El incremento de las floraciones de cianobacterias tóxicas está siendo cada vez más reportado en todo el mundo, debido a la eutroficación, a los efectos del cambio climático y a un mayor el esfuerzo de monitoreo en ecosistemas acuáticos. En Cuba varios ecosistemas de la región oriental han sido trabajados con este propósito, debido a que las condiciones climáticas favorecen dichos eventos. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar y documentar una situación de riesgo, implementando un protocolo de gestión contextualizado para la Laguna San Blas, Camagüey. Ante un reporte de intoxicación en animales domésticos y silvestres, asociado a la exposición a aguas de la laguna, y posibles manifestaciones en humanos, se desarrollan acciones de monitoreo, activando un protocolo de gestión de riesgo. Esta laguna es un reservorio de pequeño tamaño con aguas eutróficas, sometido a una fuerte presión antrópica. Se detectó una situación de riesgo en el ecosistema, confirmándose la presencia de un bloom mixto de especies toxigénicas, siendo mayoritaria la cianobacteria Anabaena torques-reginae, el que transcurre con el acompañamiento de al menos otras nueve especies, y remite a los treinta días. Se implementaron acciones tempranas para el manejo de la situación de riesgo a partir de un diseño metodológico que involucra la participación de expertos, y ciudadana, liderado por el Laboratorio de Criminalística de Camagüey, el Gobierno y el Laboratorio de Ecotoxicología y Servicios Ambientales del Centro Nacional de Electromagnetismo Aplicado, facilitando la toma de decisiones gubernamentales acertadas. Resultaron factores clave de éxito, las alianzas interinstitucionales, el liderazgo gubernamental, y la comunicación oportuna.